Alex38Lyon/Synthese-PSM_LARRA
1
0
Fork 0
mirror of https://github.com/Alex38Lyon/Synthese-PSM_LARRA.git synced 2026-06-01 22:00:53 +00:00
Code Issues Packages Projects Releases Wiki Activity

pyCreateTh

Browse Source
This commit is contained in:
Alex38Lyon
2025-07-02 14:17:37 +02:00
parent 77d57d67dc
commit 74e5b3f800
8 changed files with 178 additions and 105 deletions
Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files
README.md
+63
View File
@@ -0,0 +1,63 @@
# Base de données Topographiques des systèmes karstiques du massif de la Pierre Saint Martin - Larra
Ce dépôt contient les données topographiques et les dessins associés des cavités du massif de la Pierre Saint Martin - Larra.
Ce dépôt est mis à jour à chaque fois qu'une nouvelle topographie est rajoutée à l'un des systèmes décrits dans cette base de données.
Si besoin, des templates pour Therion sont disponibles sur [https://github.com/robertxa/Th-Config-Xav](https://github.com/robertxa/Th-Config-Xav).
## Description
Ce dépôt est en cours de développement et a pour objectif de sauvegarder et partager les données topographiques chiffrées et dessinées au format [Therion](https://therion.speleo.sk/).
Ce travail est réalisé par les membres de l'ARSIP, collectif d'exploration du massif de la Pierre Saint Martin.
<p align="center">
<a href="http://arsip.fr/">
<img src="/Logos/Logo-ARSIP-Synthese-Topo.jpg" alt="Logo ARSIP" width="200px">
</a>
</p>
Une convention a aussi été mise en place pour la gestion des points d'interrogation, avec la définition des différents champs :
- **Champ "Code"** : décrit le type de terminus. Il peut prendre les valeurs :
- `A` : il suffit d'y aller et de continuer, pas d'obstacles
- `D` : Désobstruction nécessaire
- `E` : Escalade nécessaire
- `P` : Puits non descendu
- `Q` : non renseigné sur les topographies anciennes, c'est à voir/vérifier
- `S` : Siphon à plonger
- `T` : Trémie à désobstruer
- **Champ "Cavite"** : nom de la cavité concernée
- **Champ "Reseau"** : partie de la cavité où se situe le point d'interrogation (pour le localiser rapidement sur les topographies)
- **Champ "CA"** : rempli s'il y a présence de courant d'air, avec éventuellement des remarques/commentaires
**Exemple** :
```text
point 3922.0 1660.0 continuation -attr code Q -attr Cavite "GL102" -attr reseau "Grand Chao" -text "Rivière à topographier" -attr CA "inconnu"
```
## Licence
L'ensemble de ces données est publié sous la licence libre Creative Commons CC BY-NC-ND 4.0 (Attribution, partage à l'identique et pas d'utilisation commerciale) :
[https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/](https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)
<p align="center">
<a href="https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/">
<img src="https://mirrors.creativecommons.org/presskit/buttons/88x31/png/by-nc-nd.png" alt="Licence CC BY-NC-ND" width="100px">
</a>
</p>
## Auteur de la base de données
Alexandre PONT (<alexandre dot pont at yahoo dot fr>) pour le compte de l'ARSIP
## Contact
Pour plus d'informations, vous pouvez contacter l'ARSIP : [https://www.arsip.fr/contactez-nous](https://www.arsip.fr/contactez-nous)
## Remerciements
Cette base de données est construite sur le modèle de celle des [massifs du Folly et de Criou](https://github.com/robertxa/Topographies-Samoens_Folly), développée par Xavier Robert,
un grand merci pour le soutien actif.
README.rst
-76
View File
@@ -1,76 +0,0 @@
Base de données Topographiques des systèmes karstiques du massif de la Pierre Saint Martin - Larra
==========================================================================================================
Ce dépôt contient les données topographiques et les dessins associés des cavités du massif de la Pierre Saint Martin - Larra .
Ce dépôt est mis à jour à chaque fois qu'une nouvelle topographie est rajoutée à l'un des systèmes décrit dans cette base de données.
Si besoin, des templates pour Therion sont disponibles sur https://github.com/robertxa/Th-Config-Xav .
Description
-----------
Ce dépôt est en cours de développement et a pour objectif de sauvegarder et partager les données topographiques chiffrées et dessinées au format `Therion <https://therion.speleo.sk/>`_.
Ce travail est réalisé par les menbres de l'ARSIP, collectif d'exploration du massif de la pierre Saint Martin
.. image:: /Logos/Logo-ARSIP-Synthese-Topo.jpg
:target: http://arsip.fr/
:align: center
:width: 200px
Une convention a aussi été mise en place pour la gestion des points d'interrogation, avec la définition des différents champs :
* le champ "Code" qui décrit le type de terminus. Il peut prendre les valeurs :
* A : il suffit d'y aller et de continuer, pas d'obstacles
* D : Désobstruction nécessaire,
* E : Escalade nécessaire,
* P : Puits non descendu,
* Q : non renseigné sur les topographies anciennes, c'est à voir/vérifier,
* S : Siphon à plonger,
* T : Trémie à désobstruer
* le champ "Cavite" qui donne le nom de la cavité en question,
* le champ "Reseau" qui indique la partie de la cavité où se situe le point d'interrogation (pour pouvoir le retrouver plus rapidement sur les topographies),
* le champ "CA" qui est rempli si présence de courant d'air, avec éventuellement des remarques/commentaires.
Exemple :
point 3922.0 1660.0 continuation -attr code Q -attr Cavite "GL102" -attr reseau "Grand Chao" -text "Rivière à topographier" -attr CA "inconnu"
Licence
-------
L'ensemble de ces données est publié sous la licence libre Creative Commons CC BY-NC-ND 4.0 (Attribution, partage à l'identique et pas d'utilisation commerciale) :
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
.. image:: https://mirrors.creativecommons.org/presskit/buttons/88x31/png/by-nc-nd.png
:align: center
:width: 100px
:target: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Auteur de la base de données
----------------------------
Alexandre PONT (alexandre dot pont at yahoo dot fr ) pour le compte de l'ARSIP
Contact
--------
Pour plus d'informations, vous pouvez contacter L'ARSIP : https://www.arsip.fr/contactez-nous
Remerciements
-------------
Cette base de données est construite sur le modèle de celle des `massifs du Folly et de Criou <https://github.com/robertxa/Topographies-Samoens_Folly>`_, développée par Xavier Robert
), un grand merci pour le soutien actif
Scripts/pyCreateTh/Lib/__pycache__/general_fonctions.cpython-313.pyc
BIN
View File
Binary file not shown.
Scripts/pyCreateTh/Lib/__pycache__/therion.cpython-313.pyc
BIN
View File
Binary file not shown.
Scripts/pyCreateTh/Lib/general_fonctions.py
+1 -1
View File
@@ -249,7 +249,7 @@ def read_config(config_file):
global_data.stationNamesInTh2 = bool(config['Application_Data']['station_name_in_th2_files'])
if 'Application_Data' in config and 'kSmooth' in config['Application_Data']:
global_data.therionPath = float(config['Application_Data']['kSmooth'])
global_data.kSmooth = float(config['Application_Data']['kSmooth'])
Scripts/pyCreateTh/Lib/therion.py
+2
View File
@@ -22,6 +22,8 @@ def compile_template(template, template_args, totReadMeError = "", **kwargs ):
try:
tmpdir = tempfile.mkdtemp()
config = template.format(**template_args, tmpdir=tmpdir.replace("\\", "/"))
log.debug(f"{config}\n")
Scripts/pyCreateTh/config.ini
+2 -2
View File
@@ -28,8 +28,8 @@ therion_path = C:\Program Files\Therion\therion.exe
survey_prefix_name = Explo_
# Options for Th2 files
shot_lines_in_th2_files = True
station_name_in_th2_files = True
shot_lines_in_th2_files = False
station_name_in_th2_files = False
wall_lines_in_th2_files = False
# Koef for smoothing wall
Scripts/pyCreateTh/pyCreateTh.py
+110 -26
View File
@@ -42,12 +42,13 @@ En cours :
"""
Version = "2025.07.01"
Version = "2025.07.02"
#################################################################################################
#################################################################################################
import os, re, argparse, shutil, sys, time, math
from os.path import isfile, join, abspath, splitext
from pathlib import Path
import numpy as np
import networkx as nx
import pandas as pd
@@ -423,7 +424,7 @@ def parse_xvi_file(th_name_xvi):
return stations, lines, splays, x_min, x_max, y_min, y_max, x_ecart, y_ecart
#################################################################################################
def assign_groups_and_ranks(df_lines):
def assign_groups_and_ranks_Old(df_lines):
G = nx.Graph()
for _, row in df_lines.iterrows():
G.add_edge(row["name1"], row["name2"])
@@ -483,6 +484,9 @@ def assign_groups_and_ranks(df_lines):
df_equates["group_id"] = df_equates["group_id"].astype(int)
df_equates["start_point"] = df_equates["start_point"].astype(str)
df_equates["end_point"] = df_equates["end_point"].astype(str)
print("df_result columns:", df_result.columns)
print("df_result empty:", df_result.empty)
# Ajout de la colonne max_rank
max_ranks = df_result.groupby("group_id")["rank_in_group"].max().reset_index()
@@ -501,6 +505,92 @@ def assign_groups_and_ranks(df_lines):
return df_result, df_equates
def assign_groups_and_ranks(df_lines):
G = nx.Graph()
for _, row in df_lines.iterrows():
G.add_edge(row["name1"], row["name2"])
used_edges = set()
results = []
equates = [] # Liste des (group_id, start_point, end_point)
group_id = 0
def walk_path(u, prev=None):
path = []
current = u
while True:
neighbors = [n for n in G.neighbors(current) if n != prev]
if len(neighbors) != 1:
break
next_node = neighbors[0]
edge = tuple(sorted((current, next_node)))
if edge in used_edges:
break
used_edges.add(edge)
path.append(edge)
prev = current
current = next_node
return path
# Noeuds ayant un degré différent de 2
start_nodes = [n for n in G.nodes if G.degree(n) != 2]
# Si tous les nœuds ont un degré 2 : cycle fermé
if not start_nodes:
start_nodes = [list(G.nodes)[0]]
for node in start_nodes:
for neighbor in G.neighbors(node):
edge = tuple(sorted((node, neighbor)))
if edge in used_edges:
continue
used_edges.add(edge)
path = [(node, neighbor)] + walk_path(neighbor, node)
for rank, (n1, n2) in enumerate(path):
match = df_lines[(df_lines["name1"] == n1) & (df_lines["name2"] == n2)]
if match.empty:
match = df_lines[(df_lines["name1"] == n2) & (df_lines["name2"] == n1)]
if not match.empty:
row = match.iloc[0].copy()
row["group_id"] = group_id
row["rank_in_group"] = rank
results.append(row)
if rank == 0:
start_point = n1
end_point = path[-1][1] if path else start_point
equates.append((group_id, str(start_point), str(end_point)))
group_id += 1
# Création du DataFrame principal
df_result = pd.DataFrame(results)
# Création du DataFrame equates
df_equates = pd.DataFrame(equates, columns=["group_id", "start_point", "end_point"])
df_equates["group_id"] = df_equates["group_id"].astype(int)
df_equates["start_point"] = df_equates["start_point"].astype(str)
df_equates["end_point"] = df_equates["end_point"].astype(str)
# Ajout de la colonne max_rank (si possible)
if not df_result.empty and "group_id" in df_result.columns:
max_ranks = df_result.groupby("group_id")["rank_in_group"].max().reset_index()
max_ranks.rename(columns={"rank_in_group": "max_rank"}, inplace=True)
max_ranks["max_rank"] = max_ranks["max_rank"].astype(int)
df_equates = df_equates.merge(max_ranks, on="group_id", how="left")
else:
df_equates["max_rank"] = 0
# Ajout de la colonne start_group (raccord logique avec un autre groupe)
end_to_group = df_equates[["end_point", "group_id"]].copy()
end_to_group.rename(columns={"end_point": "start_point", "group_id": "start_group"}, inplace=True)
end_to_group["start_point"] = end_to_group["start_point"].astype(str)
df_equates = df_equates.merge(end_to_group, on="start_point", how="left")
# Remplacer les NaN dans start_group par 0
df_equates["start_group"] = df_equates["start_group"].fillna(0).astype(int)
return df_result, df_equates
#################################################################################################
def add_start_end_splays(df_splays_complet, df_equates):
@@ -560,7 +650,7 @@ def add_start_end_splays(df_splays_complet, df_equates):
return df_splays_new
#################################################################################################
def align_points(smoothX1, smoothY1, X, Y, smoothX2, smoothY2):
# Vecteurs d'origine vers smooth1 et smooth2
dx1, dy1 = smoothX1 - X, smoothY1 - Y
@@ -591,7 +681,6 @@ def align_points(smoothX1, smoothY1, X, Y, smoothX2, smoothY2):
return (_smoothX1, _smoothY1), (_smoothX2, _smoothY2)
#################################################################################################
def wall_construction_smoothed(df_lines, df_splays, x_min, x_max, y_min, y_max):
@@ -610,7 +699,6 @@ def wall_construction_smoothed(df_lines, df_splays, x_min, x_max, y_min, y_max):
if len(df_lines) <= 2 or len(df_splays) <= 2:
return th2_walls, 0, 0, 0, 0
df_lines, df_equates = assign_groups_and_ranks(df_lines)
# Conversion en polaire
@@ -969,7 +1057,6 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
if not survey:
raise NoSurveysFoundException(f"No survey found with that selector")
if UPDATE :
DEST_PATH = os.path.dirname(args.file)
log.info(f"Update th2 files: {Colors.ENDC}{DEST_PATH}")
@@ -984,7 +1071,6 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
log.debug(f"\t{Colors.BLUE}DEST_PATH: {Colors.ENDC} {DEST_PATH}")
log.debug(f"\t{Colors.BLUE}ABS_PATH: {Colors.ENDC} {ABS_PATH}")
#################################################################################################
# Copy template folders #
#################################################################################################
@@ -1000,20 +1086,19 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
log.info(f"Compiling 2D XVI file: {Colors.ENDC}{TH_NAME}")
if UPDATE:
template_args = {
"th_file": DEST_PATH + "/" + TH_NAME + ".th",
"selector": survey.therion_id,
"th_name": DEST_PATH + "/" + TH_NAME,
"scale": int(int(SCALE)/10),
}
thFile = Path(DEST_PATH + "\\" + TH_NAME + ".th")
thName = Path(DEST_PATH + "\\" + TH_NAME)
else :
template_args = {
"th_file": DEST_PATH + "/Data/" + TH_NAME + ".th",
thFile = Path(DEST_PATH + "\\Data\\" + TH_NAME + ".th")
thName = Path(DEST_PATH + "\\Data\\" + TH_NAME)
template_args = {
"th_file": thFile,
"selector": survey.therion_id,
"th_name": DEST_PATH + "/Data/" + TH_NAME,
"th_name": thName,
"XVIscale": globalData.XVIScale,
}
}
logfile, tmpdir, totReadMeError = compile_template(globalData.thconfigTemplate, template_args, totReadMeError, cleanup=False, therion_path=globalData.therionPath)
@@ -1026,8 +1111,7 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
else :
flagErrorCompile = False
stat = get_stats_from_log(logfile)
#################################################################################################
# Update files #
#################################################################################################
@@ -1508,7 +1592,7 @@ def mak_to_th_file(ENTRY_FILE) :
for file in datFiles :
ABS_file = os.path.dirname(abspath(args.file)) + "\\"+ file
content, val = load_text_file_utf8(ABS_file, os.path.basename(ABS_file))
content, val, encodage = load_text_file_utf8(ABS_file, os.path.basename(ABS_file))
section = content.split('\x0c')
QtySections += len(section)
@@ -1553,9 +1637,9 @@ def mak_to_th_file(ENTRY_FILE) :
for file in datFiles:
if globalData.error_count > 0:
bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
else :
bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}")
bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}")
_file = os.path.dirname(abspath(args.file)) + "\\" + file
shutil.copy(_file, folderDest + "\\Data\\")
@@ -2798,9 +2882,9 @@ def dat_to_th_files (ENTRY_FILE, fixPoints = [], crs_wkt = "", CONFIG_PATH = "",
surveyCount += 1
if globalData.error_count > 0:
bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
else :
bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}")
bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}")
bar()
#################################################################################################
@@ -3081,9 +3165,9 @@ if __name__ == u'__main__':
with redirect_stdout(sys.__stdout__):
for i in range(1):
if globalData.error_count > 0:
bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
else :
bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}")
bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}")
stationList, fileTitle, totReadMeError, thread2 = dat_to_th_files (ABS_file , fixPoints = [], crs_wkt = "", CONFIG_PATH = _ConfigPath, totReadMeError = "", bar = bar)
threads += thread2
bar()