From 74e5b3f8003526ff23322ce9d40bc576e3092850 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Alex38Lyon <55714436+Alex38Lyon@users.noreply.github.com>
Date: Wed, 2 Jul 2025 14:17:37 +0200
Subject: [PATCH] pyCreateTh

---
 README.md                                     |  63 ++++++++
 README.rst                                    |  76 ----------
 .../general_fonctions.cpython-313.pyc         | Bin 13369 -> 13374 bytes
 .../Lib/__pycache__/therion.cpython-313.pyc   | Bin 14227 -> 14230 bytes
 Scripts/pyCreateTh/Lib/general_fonctions.py   |   2 +-
 Scripts/pyCreateTh/Lib/therion.py             |   2 +
 Scripts/pyCreateTh/config.ini                 |   4 +-
 Scripts/pyCreateTh/pyCreateTh.py              | 136 ++++++++++++++----
 8 files changed, 178 insertions(+), 105 deletions(-)
 create mode 100644 README.md
 delete mode 100644 README.rst

diff --git a/README.md b/README.md
new file mode 100644
index 0000000..07958e8
--- /dev/null
+++ b/README.md
@@ -0,0 +1,63 @@
+
+# Base de données Topographiques des systèmes karstiques du massif de la Pierre Saint Martin - Larra
+
+Ce dépôt contient les données topographiques et les dessins associés des cavités du massif de la Pierre Saint Martin - Larra.
+
+Ce dépôt est mis à jour à chaque fois qu'une nouvelle topographie est rajoutée à l'un des systèmes décrits dans cette base de données.
+
+Si besoin, des templates pour Therion sont disponibles sur [https://github.com/robertxa/Th-Config-Xav](https://github.com/robertxa/Th-Config-Xav).
+
+## Description
+
+Ce dépôt est en cours de développement et a pour objectif de sauvegarder et partager les données topographiques chiffrées et dessinées au format [Therion](https://therion.speleo.sk/).  
+Ce travail est réalisé par les membres de l'ARSIP, collectif d'exploration du massif de la Pierre Saint Martin.
+
+<p align="center">
+  <a href="http://arsip.fr/">
+    <img src="/Logos/Logo-ARSIP-Synthese-Topo.jpg" alt="Logo ARSIP" width="200px">
+  </a>
+</p>
+
+Une convention a aussi été mise en place pour la gestion des points d'interrogation, avec la définition des différents champs :
+
+- **Champ "Code"** : décrit le type de terminus. Il peut prendre les valeurs :
+  - `A` : il suffit d'y aller et de continuer, pas d'obstacles  
+  - `D` : Désobstruction nécessaire  
+  - `E` : Escalade nécessaire  
+  - `P` : Puits non descendu  
+  - `Q` : non renseigné sur les topographies anciennes, c'est à voir/vérifier  
+  - `S` : Siphon à plonger  
+  - `T` : Trémie à désobstruer
+
+- **Champ "Cavite"** : nom de la cavité concernée  
+- **Champ "Reseau"** : partie de la cavité où se situe le point d'interrogation (pour le localiser rapidement sur les topographies)  
+- **Champ "CA"** : rempli s'il y a présence de courant d'air, avec éventuellement des remarques/commentaires
+
+**Exemple** :  
+```text
+point 3922.0 1660.0 continuation -attr code Q -attr Cavite "GL102" -attr reseau "Grand Chao" -text "Rivière à topographier" -attr CA "inconnu"
+```
+
+## Licence
+
+L'ensemble de ces données est publié sous la licence libre Creative Commons CC BY-NC-ND 4.0 (Attribution, partage à l'identique et pas d'utilisation commerciale) :  
+[https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/](https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)
+
+<p align="center">
+  <a href="https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/">
+    <img src="https://mirrors.creativecommons.org/presskit/buttons/88x31/png/by-nc-nd.png" alt="Licence CC BY-NC-ND" width="100px">
+  </a>
+</p>
+
+## Auteur de la base de données
+
+Alexandre PONT (<alexandre dot pont at yahoo dot fr>) pour le compte de l'ARSIP
+
+## Contact
+
+Pour plus d'informations, vous pouvez contacter l'ARSIP : [https://www.arsip.fr/contactez-nous](https://www.arsip.fr/contactez-nous)
+
+## Remerciements
+
+Cette base de données est construite sur le modèle de celle des [massifs du Folly et de Criou](https://github.com/robertxa/Topographies-Samoens_Folly), développée par Xavier Robert,  
+un grand merci pour le soutien actif.
diff --git a/README.rst b/README.rst
deleted file mode 100644
index a1e51ac..0000000
--- a/README.rst
+++ /dev/null
@@ -1,76 +0,0 @@
-Base de données Topographiques des systèmes karstiques du massif de la Pierre Saint Martin - Larra 
-==========================================================================================================
-
-Ce dépôt contient les données topographiques et les dessins associés des cavités du massif de la Pierre Saint Martin - Larra .
-
-Ce dépôt est mis à jour à chaque fois qu'une nouvelle topographie est rajoutée à l'un des systèmes décrit dans cette base de données.
-
-Si besoin, des templates pour Therion sont disponibles sur https://github.com/robertxa/Th-Config-Xav .
-
-
-Description
------------
-
-Ce dépôt est en cours de développement et a pour objectif de sauvegarder et partager les données topographiques chiffrées et dessinées au format `Therion  <https://therion.speleo.sk/>`_.
-Ce travail est réalisé par les menbres de l'ARSIP, collectif d'exploration du massif de la pierre Saint Martin 
-
-.. image:: /Logos/Logo-ARSIP-Synthese-Topo.jpg
-  :target: http://arsip.fr/
-  :align: center
-  :width: 200px
-
-
-
-Une convention a aussi été mise en place pour la gestion des points d'interrogation, avec la définition des différents champs :
-
-	* le champ "Code" qui décrit le type de terminus. Il peut prendre les valeurs : 
-	
-		* A : il suffit d'y aller et de continuer, pas d'obstacles
-		
-		* D : Désobstruction nécessaire, 
-		
-		* E : Escalade nécessaire, 
-		
-		* P : Puits non descendu,
-		
-		* Q : non renseigné sur les topographies anciennes, c'est à voir/vérifier,
-		
-		* S : Siphon à plonger, 
-		
-		* T : Trémie à désobstruer
-	
-	* le champ "Cavite" qui donne le nom de la cavité en question,
-	
-	* le champ "Reseau" qui indique la partie de la cavité où se situe le point d'interrogation (pour pouvoir le retrouver plus rapidement sur les topographies),
-	
-	* le champ "CA" qui est rempli si présence de courant d'air, avec éventuellement des remarques/commentaires.
-	
-Exemple :  
-point 3922.0 1660.0 continuation -attr code Q -attr Cavite "GL102" -attr reseau "Grand Chao"  -text "Rivière à topographier" -attr CA "inconnu"
-
-Licence
--------
-
-L'ensemble de ces données est publié sous la licence libre Creative Commons CC BY-NC-ND 4.0 (Attribution, partage à l'identique et pas d'utilisation commerciale) :
-https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
-
-.. image:: https://mirrors.creativecommons.org/presskit/buttons/88x31/png/by-nc-nd.png
-  :align: center
-  :width: 100px
-  :target: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
-
-Auteur de la base de données
-----------------------------
-
-Alexandre PONT (alexandre dot pont at yahoo dot fr ) pour le compte de l'ARSIP 
-
-Contact
---------
-
-Pour plus d'informations, vous pouvez contacter L'ARSIP : https://www.arsip.fr/contactez-nous
-
-Remerciements
--------------
-
-Cette base de données est construite sur le modèle de celle des `massifs du Folly et de Criou <https://github.com/robertxa/Topographies-Samoens_Folly>`_, développée par Xavier Robert
-), un grand merci pour le soutien actif
diff --git a/Scripts/pyCreateTh/Lib/__pycache__/general_fonctions.cpython-313.pyc b/Scripts/pyCreateTh/Lib/__pycache__/general_fonctions.cpython-313.pyc
index 22e7d3868302e2d7387fc68377e5e4f2015d8e3a..bf64290c72b3122fb6d310dc5800adabee5c638f 100644
GIT binary patch
delta 81
zcmdm)u`h%7GcPX}0}wboOv%vR$h%OEQGD}yxvz|j5|fuId}b|b1j=omp%}s}E~mV}
k?Si)LMHRapl^0b!FUxuLa9`z+-ps7}n~%|Z@_%D108MopzW@LL

delta 75
zcmdm&u``4BGcPX}0}vz~OU}^W$h%OEQE2mexvz|j;**yueBL})F@#xMNqq&|1%1bh
f8cqi+FKYN+R`ToNzRDrLnM3tAAEW<d785G~(qI{z

diff --git a/Scripts/pyCreateTh/Lib/__pycache__/therion.cpython-313.pyc b/Scripts/pyCreateTh/Lib/__pycache__/therion.cpython-313.pyc
index acda215877e4abcc705c23992d54552326bc03c8..c4b22433d2fc26cb145fe55faa90b6681a6804b7 100644
GIT binary patch
delta 119
zcmV--0EqvSZ<cQj^9>CO00000729NJ&an-w5)=^y004jh*bWeYN7xM!fJX2FKmn7?
z5;6t!2mlETvjG$Q69Ia&{wAOS0dKRPD3$~PWV1FcxdQ=Qv+yv+0Rg46w=&QH0kyM;
ZG+qG#!L#QzS^)<`0RdbA@=}vXH%sKVCy4+6

delta 125
zcmV-@0D}LPZ<B8g^9>CO00000OxR;+ys-_e5)%#u004jh*bWeYN7xM!fJX2FK9kK7
zG6UoY3$p|h{1X9qvjHcd0Re5Zq9~RG0b;W`Ex7{$TC?*o#sLANv$`_S0RgkKi!@#V
f2EPCR0CP8!kTeyu1U5hc2SEV=TmkY<lS?;C%rYme

diff --git a/Scripts/pyCreateTh/Lib/general_fonctions.py b/Scripts/pyCreateTh/Lib/general_fonctions.py
index c292747..d832295 100644
--- a/Scripts/pyCreateTh/Lib/general_fonctions.py
+++ b/Scripts/pyCreateTh/Lib/general_fonctions.py
@@ -249,7 +249,7 @@ def read_config(config_file):
         global_data.stationNamesInTh2 = bool(config['Application_Data']['station_name_in_th2_files']) 
         
     if 'Application_Data' in config and 'kSmooth' in config['Application_Data']:
-        global_data.therionPath = float(config['Application_Data']['kSmooth'])
+        global_data.kSmooth = float(config['Application_Data']['kSmooth'])
             
 
 
diff --git a/Scripts/pyCreateTh/Lib/therion.py b/Scripts/pyCreateTh/Lib/therion.py
index ba4a50b..6c79a6d 100644
--- a/Scripts/pyCreateTh/Lib/therion.py
+++ b/Scripts/pyCreateTh/Lib/therion.py
@@ -22,6 +22,8 @@ def compile_template(template, template_args, totReadMeError = "", **kwargs ):
     try:
         tmpdir = tempfile.mkdtemp()
         config = template.format(**template_args, tmpdir=tmpdir.replace("\\", "/"))
+        
+        
 
         log.debug(f"{config}\n")
 
diff --git a/Scripts/pyCreateTh/config.ini b/Scripts/pyCreateTh/config.ini
index c2c2837..a68e595 100644
--- a/Scripts/pyCreateTh/config.ini
+++ b/Scripts/pyCreateTh/config.ini
@@ -28,8 +28,8 @@ therion_path = C:\Program Files\Therion\therion.exe
 survey_prefix_name = Explo_
 
 # Options for Th2 files 
-shot_lines_in_th2_files = True
-station_name_in_th2_files = True
+shot_lines_in_th2_files = False
+station_name_in_th2_files = False
 wall_lines_in_th2_files = False
 
 # Koef for smoothing wall 
diff --git a/Scripts/pyCreateTh/pyCreateTh.py b/Scripts/pyCreateTh/pyCreateTh.py
index 389a4ff..7b872de 100644
--- a/Scripts/pyCreateTh/pyCreateTh.py
+++ b/Scripts/pyCreateTh/pyCreateTh.py
@@ -42,12 +42,13 @@ En cours :
 
 """
 
-Version = "2025.07.01"  
+Version = "2025.07.02"  
 
 #################################################################################################
 #################################################################################################
 import os, re, argparse, shutil, sys, time, math
 from os.path import isfile, join, abspath, splitext
+from pathlib import Path
 import numpy as np
 import networkx as nx
 import pandas as pd
@@ -423,7 +424,7 @@ def parse_xvi_file(th_name_xvi):
     return stations, lines, splays, x_min, x_max, y_min, y_max, x_ecart, y_ecart
 
 #################################################################################################
-def assign_groups_and_ranks(df_lines):
+def assign_groups_and_ranks_Old(df_lines):
     G = nx.Graph()
     for _, row in df_lines.iterrows():
         G.add_edge(row["name1"], row["name2"])
@@ -483,6 +484,9 @@ def assign_groups_and_ranks(df_lines):
     df_equates["group_id"] = df_equates["group_id"].astype(int)
     df_equates["start_point"] = df_equates["start_point"].astype(str)
     df_equates["end_point"] = df_equates["end_point"].astype(str)
+    
+    print("df_result columns:", df_result.columns)
+    print("df_result empty:", df_result.empty)
 
     # Ajout de la colonne max_rank
     max_ranks = df_result.groupby("group_id")["rank_in_group"].max().reset_index()
@@ -501,6 +505,92 @@ def assign_groups_and_ranks(df_lines):
 
     return df_result, df_equates
 
+def assign_groups_and_ranks(df_lines):
+    G = nx.Graph()
+    for _, row in df_lines.iterrows():
+        G.add_edge(row["name1"], row["name2"])
+
+    used_edges = set()
+    results = []
+    equates = []  # Liste des (group_id, start_point, end_point)
+    group_id = 0
+
+    def walk_path(u, prev=None):
+        path = []
+        current = u
+        while True:
+            neighbors = [n for n in G.neighbors(current) if n != prev]
+            if len(neighbors) != 1:
+                break
+            next_node = neighbors[0]
+            edge = tuple(sorted((current, next_node)))
+            if edge in used_edges:
+                break
+            used_edges.add(edge)
+            path.append(edge)
+            prev = current
+            current = next_node
+        return path
+
+    # Noeuds ayant un degré différent de 2
+    start_nodes = [n for n in G.nodes if G.degree(n) != 2]
+
+    # Si tous les nœuds ont un degré 2 : cycle fermé
+    if not start_nodes:
+        start_nodes = [list(G.nodes)[0]]
+
+    for node in start_nodes:
+        for neighbor in G.neighbors(node):
+            edge = tuple(sorted((node, neighbor)))
+            if edge in used_edges:
+                continue
+            used_edges.add(edge)
+            path = [(node, neighbor)] + walk_path(neighbor, node)
+
+            for rank, (n1, n2) in enumerate(path):
+                match = df_lines[(df_lines["name1"] == n1) & (df_lines["name2"] == n2)]
+                if match.empty:
+                    match = df_lines[(df_lines["name1"] == n2) & (df_lines["name2"] == n1)]
+                if not match.empty:
+                    row = match.iloc[0].copy()
+                    row["group_id"] = group_id
+                    row["rank_in_group"] = rank
+                    results.append(row)
+                    if rank == 0:
+                        start_point = n1
+            end_point = path[-1][1] if path else start_point
+            equates.append((group_id, str(start_point), str(end_point)))
+            group_id += 1
+
+    # Création du DataFrame principal
+    df_result = pd.DataFrame(results)
+
+    # Création du DataFrame equates
+    df_equates = pd.DataFrame(equates, columns=["group_id", "start_point", "end_point"])
+    df_equates["group_id"] = df_equates["group_id"].astype(int)
+    df_equates["start_point"] = df_equates["start_point"].astype(str)
+    df_equates["end_point"] = df_equates["end_point"].astype(str)
+
+    # Ajout de la colonne max_rank (si possible)
+    if not df_result.empty and "group_id" in df_result.columns:
+        max_ranks = df_result.groupby("group_id")["rank_in_group"].max().reset_index()
+        max_ranks.rename(columns={"rank_in_group": "max_rank"}, inplace=True)
+        max_ranks["max_rank"] = max_ranks["max_rank"].astype(int)
+        df_equates = df_equates.merge(max_ranks, on="group_id", how="left")
+    else:
+        df_equates["max_rank"] = 0
+
+    # Ajout de la colonne start_group (raccord logique avec un autre groupe)
+    end_to_group = df_equates[["end_point", "group_id"]].copy()
+    end_to_group.rename(columns={"end_point": "start_point", "group_id": "start_group"}, inplace=True)
+    end_to_group["start_point"] = end_to_group["start_point"].astype(str)
+    df_equates = df_equates.merge(end_to_group, on="start_point", how="left")
+
+    # Remplacer les NaN dans start_group par 0
+    df_equates["start_group"] = df_equates["start_group"].fillna(0).astype(int)
+
+    return df_result, df_equates
+
 
 #################################################################################################
 def add_start_end_splays(df_splays_complet, df_equates):
@@ -560,7 +650,7 @@ def add_start_end_splays(df_splays_complet, df_equates):
     return df_splays_new
 
 
-
+#################################################################################################
 def align_points(smoothX1, smoothY1, X, Y, smoothX2, smoothY2):
     # Vecteurs d'origine vers smooth1 et smooth2
     dx1, dy1 = smoothX1 - X, smoothY1 - Y
@@ -591,7 +681,6 @@ def align_points(smoothX1, smoothY1, X, Y, smoothX2, smoothY2):
     return (_smoothX1, _smoothY1), (_smoothX2, _smoothY2)
 
 
-
 #################################################################################################
 def wall_construction_smoothed(df_lines, df_splays, x_min, x_max, y_min, y_max):
 
@@ -610,7 +699,6 @@ def wall_construction_smoothed(df_lines, df_splays, x_min, x_max, y_min, y_max):
     if len(df_lines) <= 2 or len(df_splays) <= 2:
         return th2_walls, 0, 0, 0, 0
 
-
     df_lines, df_equates = assign_groups_and_ranks(df_lines)
    
     # Conversion en polaire
@@ -969,7 +1057,6 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
     if not survey:
         raise NoSurveysFoundException(f"No survey found with that selector")
     
-   
     if UPDATE : 
         DEST_PATH = os.path.dirname(args.file)
         log.info(f"Update th2 files: {Colors.ENDC}{DEST_PATH}")
@@ -984,7 +1071,6 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
         log.debug(f"\t{Colors.BLUE}DEST_PATH:     {Colors.ENDC} {DEST_PATH}")
         log.debug(f"\t{Colors.BLUE}ABS_PATH:      {Colors.ENDC} {ABS_PATH}")
     
-    
     #################################################################################################    
     # Copy template folders                                                                         #
     #################################################################################################
@@ -1000,20 +1086,19 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
     log.info(f"Compiling 2D XVI file: {Colors.ENDC}{TH_NAME}")
     
     if UPDATE: 
-        template_args = {
-            "th_file": DEST_PATH + "/" + TH_NAME + ".th",  
-            "selector": survey.therion_id,
-            "th_name": DEST_PATH + "/" + TH_NAME, 
-            "scale": int(int(SCALE)/10),
-        }
+        thFile = Path(DEST_PATH + "\\" + TH_NAME + ".th")
+        thName = Path(DEST_PATH + "\\" + TH_NAME)
 
     else :
-        template_args = {
-            "th_file": DEST_PATH + "/Data/" + TH_NAME + ".th",  
+        thFile = Path(DEST_PATH + "\\Data\\" + TH_NAME + ".th")  
+        thName = Path(DEST_PATH + "\\Data\\" + TH_NAME) 
+
+    template_args = {
+            "th_file": thFile,  
             "selector": survey.therion_id,
-            "th_name": DEST_PATH + "/Data/" + TH_NAME, 
+            "th_name": thName, 
             "XVIscale": globalData.XVIScale,
-        }
+    }
 
     logfile, tmpdir, totReadMeError = compile_template(globalData.thconfigTemplate, template_args, totReadMeError, cleanup=False, therion_path=globalData.therionPath)
     
@@ -1026,8 +1111,7 @@ def create_th_folders(ENTRY_FILE,
     else : 
         flagErrorCompile = False
         stat = get_stats_from_log(logfile)
-     
-         
+        
     #################################################################################################    
     # Update files                                                                                  #
     #################################################################################################
@@ -1508,7 +1592,7 @@ def mak_to_th_file(ENTRY_FILE) :
     
     for file in datFiles :       
         ABS_file = os.path.dirname(abspath(args.file)) + "\\"+ file
-        content, val = load_text_file_utf8(ABS_file, os.path.basename(ABS_file))
+        content, val, encodage = load_text_file_utf8(ABS_file, os.path.basename(ABS_file))
         section = content.split('\x0c')
         QtySections += len(section)
 
@@ -1553,9 +1637,9 @@ def mak_to_th_file(ENTRY_FILE) :
             for file in datFiles:
                 
                 if globalData.error_count > 0:
-                    bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
+                    bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
                 else :
-                    bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}")
+                    bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{file[:-4]}")
                 
                 _file = os.path.dirname(abspath(args.file)) + "\\" + file
                 shutil.copy(_file, folderDest + "\\Data\\")
@@ -2798,9 +2882,9 @@ def dat_to_th_files (ENTRY_FILE, fixPoints = [], crs_wkt = "", CONFIG_PATH = "",
         surveyCount += 1
         
         if globalData.error_count > 0:
-            bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
+            bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
         else :
-            bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}")
+            bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ENTRY_FILE)[:-4]}{Colors.INFO}, survey: {Colors.ENDC}{currentSurveyName}")
         bar()
 
 #################################################################################################     
@@ -3081,9 +3165,9 @@ if __name__ == u'__main__':
             with redirect_stdout(sys.__stdout__):
                 for i in range(1): 
                     if globalData.error_count > 0:
-                        bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
+                        bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}{Colors.ERROR}, error: {Colors.ENDC}{globalData.error_count}")
                     else :
-                        bar.text(f"{Colors.INFO}, file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}")
+                        bar.text(f"{Colors.INFO}file: {Colors.ENDC}{os.path.basename(ABS_file)[:-4]}")
                     stationList, fileTitle, totReadMeError, thread2 = dat_to_th_files (ABS_file , fixPoints = [], crs_wkt = "", CONFIG_PATH = _ConfigPath, totReadMeError = "", bar = bar)
                     threads += thread2
                     bar()